9月24日，河北省石家庄市公安局发布情况通报称，鉴于裕华区近期连续发生疫情且源头不明，石家庄市卫健委、市公安局等部门抽调相关专业专家对全市核酸检测机构进行督查检查。在检查中发现，“石家庄和合医学检验实验室”9月14日对裕华区阳光361小区核酸检测出的一管20:1混管阳性样本未上报，导致相关人员未得到及时管控，造成9月21日出现社区传播。该实验室涉嫌违法犯罪，石家庄警方已对其立案侦查。

9月13日的时候，石家庄裕华区发布通告，为有效防范疫情传播扩散，切实保障人民群众身体健康和生命安全，经研究决定，自9月13日6时至9月16日6时，除参与城市运行、市场保供、公共服务、疫情防控等工作人员以外，裕华区范围内所有人员采取居家办公、单位暂停营业等措施，居民非必要不外出，不扎堆、不聚集，最大限度减少人员流动。 

今年5月以来，多地开展大范围核酸检测机构专项排查。据媒体不完全统计，有超过两百家核酸检测机构被要求暂停业务或进行整改。

5月的时候，北京市丰台区人民检察院经依法审查以涉嫌妨害传染病防治罪，对北京中同蓝博医学检验实验室有限公司张某某、童某某等3名犯罪嫌疑人作出批准逮捕决定。

上述三人被逮捕，是由于该公司为了节约成本，加赶进度，严重违反新冠病毒检验操作规范，在明知超量混检可能导致检测结果失准的情况下，仍然采取多管混检的方式进行检测，涉嫌妨害传染病防治罪。

此前，北京朴石医学检验实验室有限公司和北京金准医学检验实验室有限公司也在核酸检测过程中涉嫌违法犯罪，被公安机关立案，相关人员被批捕。

6月，据湖南省卫生健康委通报，共对全省657家开展核酸检测的医疗卫生机构进行集中排查整顿，其中排查结果合格547家，责令整改103家，暂停业务资质4家，未开展业务3家。在责令整改的核酸检测机构中，涉及第三方实验室5家，疾控中心14家，医疗机构84家。

同月，四川省排查整顿结果为“合格”的机构993家，责令整改并依法依规处置的机构47家、责令暂停新冠病毒核酸检测业务的机构4家。

辽宁省经排查，有23家核酸检测机构被责令整改，17家核酸检测机构暂停服务（包括3家责令暂停和14家自行停止）。

7月，陕西省应对新型冠状病毒感染肺炎疫情工作领导小组医疗救治组公示陕西省核酸检测机构排查整顿情况，其中排查整顿结果“合格”机构498家，“责令整改”机构19家。